As funcionalidades estão apresentadas em ordem alfabética e contêm símbolos para facilitar a sua identificação e correspondência com os ícones existentes na tela de controle de processos e tela do processo.

O campo Pesquisar no Menu, localizado no ínicio do Menu Principal, possibilita pesquisar a funcionalidade desejada.

O perfil básico apresenta as seguintes opções:

Acompanhamento Especial: Permite visualizar a relação dos processos da unidade que estão em acompanhamento especial e outras informações sobre cada acompanhamento, como o usuário responsável, a data de inclusão, o grupo em que ele está incluído e um campo para observação.

Base de Conhecimento: Permite descrever as etapas de um processo e anexar documentos de referência relacionados ao Tipo de Processo vinculado àquela base de conhecimento.

Blocos
       Assinatura: Permite gerenciar os blocos de assinatura criados pela unidade ou disponibilizados a ela. Possibilita que mais de um usuário, de qualquer unidade, possa assinar documentos produzidos no sistema.

       Reunião: Permite gerenciar os blocos de reunião criados pela unidade ou disponibilizados a ela. Possibilita que uma unidade disponibilize processos para conhecimento de outras unidades, sem que estas tenham uma atuação formal sobre eles, para serem discutidos em reuniões ou decisão colegiada. Essa funcionalidade permite a visualização do conteúdo dos documentos mesmo que não estejam assinados.

       Internos: Permite visualizar os blocos internos criados pela unidade. Possibilita a organização de conjuntos de processos (processos com tramitação na unidade) que possuam alguma ligação entre si. Esta forma de organização é visível apenas pela unidade que a criou.

Contatos: Permite o cadastro e consulta dos contatos que serão exibidos como opções para o preenchimento dos campos Interessados, Remetente e Destinatários, na tela de cadastro do processo ou do documento, por exemplo.

Controle de Prazos: Funcionalidade utilizada para administração de prazos dentro da unidade. É uma funcionalidade de organização interna – ou seja, outras unidades não terão acesso ao Controle de Prazos da unidade.

Controle de Processos: Direciona o usuário para a tela principal do SEI, onde são visualizados todos os processos que estão em sua unidade.

Estatísticas: Permite visualizar as estatísticas da Unidade e o Desempenho de Processos.

Favoritos: Permite visualizar e gerenciar a relação de processos salvos como favoritos na unidade, possibilitando acesso rápido a eles.

Grupos
       Contatos:Possibilita a criação de uma lista a partir da seleção de contatos cadastrados no sistema.

       E-mail: permite criar e gerenciar grupos de e-mail para o envio de mensagens eletrônicas dentro do sistema.

       Envio: Permite criar e gerenciar grupos de unidades para o envio de processos dentro do sistema.

Iniciar Processo: Permite iniciar um novo processo no SEI.

Marcadores: Permite que a unidade crie e gerencie marcadores para os processos sob sua gestão. Utilizado para organização interna da equipe de trabalho.

Painel de Controle: Funcionalidade que possibilita ao usuário ter uma visão resumida e personalizada dos processos da unidade.

Pesquisa: Possibilita a pesquisa avançada de informações, documentos ou processos.

Pontos de Controle: Recurso que permite atribuir Pontos de Controle (fases ou categorias) para acompanhamento de processos.

Processos Sobrestados: Permite visualizar a relação de processos da unidade que se encontram suspensos temporariamente e as informações relativas ao sobrestamento.

Retorno Programado: Permite verificar a relação de retornos programados da unidade – aqueles processos aos quais foram atribuídos prazos para resposta.

Textos Padrão: Permite incluir textos que sejam recorrentes na unidade para utilização em documentos e e-mails produzidos no sistema.